Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3558Q5FWC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3558Q5FWC9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3558Q5FWC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3558Q5FWC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms