Protein–RNA interactions for Protein: Q52KP5

Nxpe4, NXPE family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe4Q52KP5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nxpe4Q52KP5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nxpe4Q52KP5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nxpe4Q52KP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxpe4Q52KP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe4Q52KP5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nxpe4Q52KP5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms