Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm14685Q52KH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm14685Q52KH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm14685Q52KH6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm14685Q52KH6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm14685Q52KH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms