Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne3Q4FZC9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne3Q4FZC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syne3Q4FZC9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syne3Q4FZC9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syne3Q4FZC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms