Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Shank3Q4ACU6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Shank3Q4ACU6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Shank3Q4ACU6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shank3Q4ACU6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shank3Q4ACU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Shank3Q4ACU6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Shank3Q4ACU6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms