Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa20Q45VN2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa20Q45VN2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa20Q45VN2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms