Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx25Q3ZT31 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx25Q3ZT31 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx25Q3ZT31 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx25Q3ZT31 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx25Q3ZT31 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx25Q3ZT31 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
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