Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacs2Q3V3Q7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs2Q3V3Q7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pacs2Q3V3Q7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacs2Q3V3Q7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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