Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm906Q3V0M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm906Q3V0M1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm906Q3V0M1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm906Q3V0M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm906Q3V0M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms