Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3V0E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3V0E1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3V0E1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3V0E1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3V0E1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3V0E1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3V0E1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3V0E1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3V0E1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3V0E1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3V0E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3V0E1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q3V0E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q3V0E1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3V0E1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3V0E1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3V0E1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3V0E1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3V0E1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3V0E1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms