Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaaf3Q3UYV8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf3Q3UYV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaaf3Q3UYV8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf3Q3UYV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms