Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV17

Krt76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt76Q3UV17 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt76Q3UV17 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt76Q3UV17 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt76Q3UV17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt76Q3UV17 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt76Q3UV17 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms