Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc4Q3UMB9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Washc4Q3UMB9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Washc4Q3UMB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Washc4Q3UMB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Washc4Q3UMB9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Washc4Q3UMB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Washc4Q3UMB9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc4Q3UMB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms