Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp3Q3ULW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp3Q3ULW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp3Q3ULW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Parp3Q3ULW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp3Q3ULW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Parp3Q3ULW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Parp3Q3ULW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Parp3Q3ULW8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp3Q3ULW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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