Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ0

Gpd1l, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpd1lQ3ULJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpd1lQ3ULJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpd1lQ3ULJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpd1lQ3ULJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpd1lQ3ULJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gpd1lQ3ULJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpd1lQ3ULJ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms