Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxnd1Q3UH93 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxnd1Q3UH93 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxnd1Q3UH93 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnd1Q3UH93 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Plxnd1Q3UH93 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms