Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pank2Q3U4S0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pank2Q3U4S0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pank2Q3U4S0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pank2Q3U4S0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pank2Q3U4S0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pank2Q3U4S0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms