Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hvcn1Q3U2S8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hvcn1Q3U2S8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hvcn1Q3U2S8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hvcn1Q3U2S8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms