Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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1700066B19RikQ3TS39 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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1700066B19RikQ3TS39 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700066B19RikQ3TS39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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1700066B19RikQ3TS39 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700066B19RikQ3TS39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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1700066B19RikQ3TS39 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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1700066B19RikQ3TS39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700066B19RikQ3TS39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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1700066B19RikQ3TS39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700066B19RikQ3TS39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700066B19RikQ3TS39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700066B19RikQ3TS39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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1700066B19RikQ3TS39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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1700066B19RikQ3TS39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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1700066B19RikQ3TS39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700066B19RikQ3TS39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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1700066B19RikQ3TS39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700066B19RikQ3TS39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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1700066B19RikQ3TS39 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700066B19RikQ3TS39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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