Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c3Q3TMP1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf3c3Q3TMP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms