Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hp1bp3Q3TEA8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hp1bp3Q3TEA8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hp1bp3Q3TEA8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hp1bp3Q3TEA8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hp1bp3Q3TEA8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms