Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VrtnQ3SYK4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VrtnQ3SYK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VrtnQ3SYK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VrtnQ3SYK4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VrtnQ3SYK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VrtnQ3SYK4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VrtnQ3SYK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VrtnQ3SYK4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms