Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcerg1lQ3B807 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcerg1lQ3B807 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcerg1lQ3B807 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcerg1lQ3B807 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcerg1lQ3B807 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcerg1lQ3B807 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcerg1lQ3B807 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcerg1lQ3B807 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcerg1lQ3B807 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcerg1lQ3B807 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcerg1lQ3B807 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1lQ3B807 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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