Protein–RNA interactions for Protein: Q2EY15

Prtg, Protogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrtgQ2EY15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrtgQ2EY15 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrtgQ2EY15 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrtgQ2EY15 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrtgQ2EY15 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrtgQ2EY15 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrtgQ2EY15 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrtgQ2EY15 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrtgQ2EY15 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrtgQ2EY15 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrtgQ2EY15 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms