Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11cQ1JRP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss11cQ1JRP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11cQ1JRP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11cQ1JRP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss11cQ1JRP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss11cQ1JRP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmprss11cQ1JRP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11cQ1JRP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmprss11cQ1JRP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms