Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam47cQ14BE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam47cQ14BE7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam47cQ14BE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam47cQ14BE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam47cQ14BE7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam47cQ14BE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam47cQ14BE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms