Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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