Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 YIL108WYIL108W 2091 nt6.44□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 YNL040WYNL040W 1371 nt6.44□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 NDE2YDL085W 1638 nt6.43□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 PAU5YFL020C 369 nt6.43□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 HIS3YOR202W 663 nt6.43□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 WSC4YHL028W 1818 nt6.43□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 SRP54YPR088C 1626 nt6.43□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 POB3YML069W 1659 nt6.42□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 PUS7YOR243C 2031 nt6.42□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 NAM8YHR086W 1572 nt6.42□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 MAS2YHR024C 1449 nt6.42□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 REX2YLR059C 810 nt6.41□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 THP3YPR045C 1413 nt6.41□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 NIF3YGL221C 867 nt6.4□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.4□□□□□ -1.38
YPL162CQ12042 KGD2YDR148C 1392 nt6.4□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 APS2YJR058C 444 nt6.39□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 RSM7YJR113C 744 nt6.39□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 YKL053WYKL053W 375 nt6.39□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 AFG2YLR397C 2343 nt6.39□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 LYS20YDL182W 1287 nt6.38□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 GAS1YMR307W 1680 nt6.38□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 SAN1YDR143C 1833 nt6.37□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 HXT13YEL069C 1695 nt6.37□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 YKR012CYKR012C 378 nt6.37□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 SGF73YGL066W 1974 nt6.35□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 TIF3YPR163C 1311 nt6.35□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 MET13YGL125W 1803 nt6.35□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 AAC3YBR085W 924 nt6.35□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 PTC6YCR079W 1329 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 ENO1YGR254W 1314 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 RAD51YER095W 1203 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 IGD1YFR017C 588 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 YNL140CYNL140C 570 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 PGC1YPL206C 966 nt6.34□□□□□ -1.39
YPL162CQ12042 YBR232CYBR232C 360 nt6.33□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 YER137CYER137C 447 nt6.32□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 YIR035CYIR035C 765 nt6.32□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 MOB1YIL106W 945 nt6.31□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 NAP1YKR048C 1254 nt6.31□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 YLR460CYLR460C 1131 nt6.31□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 CCR4YAL021C 2514 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 YJL009WYJL009W 327 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 CYC3YAL039C 810 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 APT1YML022W 564 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 TMS1YDR105C 1422 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 MSB3YNL293W 1902 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 SDS24YBR214W 1584 nt6.3□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 NAS2YIL007C 663 nt6.29□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 FCP1YMR277W 2199 nt6.29□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 BNA3YJL060W 1335 nt6.28□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 RSC9YML127W 1746 nt6.28□□□□□ -1.4
YPL162CQ12042 RPL12BYDR418W 498 nt6.27□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 FLX1YIL134W 936 nt6.27□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YLR030WYLR030W 792 nt6.27□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 ADH3YMR083W 1128 nt6.27□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YEL023CYEL023C 2049 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YBL111CYBL111C 2004 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YCR025CYCR025C 411 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 INM1YHR046C 888 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 SRP102YKL154W 735 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 SEN2YLR105C 1134 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 VBA3YCL069W 1377 nt6.26□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 MRN1YPL184C 1839 nt6.25□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 CHS7YHR142W 951 nt6.25□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 BUB2YMR055C 921 nt6.25□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 OLA1YBR025C 1185 nt6.25□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 IPL1YPL209C 1104 nt6.25□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 GLY1YEL046C 1164 nt6.24□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 PHB2YGR231C 933 nt6.24□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 INO1YJL153C 1602 nt6.24□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YKR018CYKR018C 2178 nt6.24□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.23□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 GUT1YHL032C 2130 nt6.22□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YFR020WYFR020W 699 nt6.22□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 YJR149WYJR149W 1215 nt6.22□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 LRO1YNR008W 1986 nt6.22□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 CDC13YDL220C 2775 nt6.22□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 TGL5YOR081C 2250 nt6.22□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 PRB1YEL060C 1908 nt6.21□□□□□ -1.41
YPL162CQ12042 BUD31YCR063W 474 nt6.21□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 YLR280CYLR280C 351 nt6.21□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 MEP1YGR121C 1479 nt6.21□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 KTR4YBR199W 1395 nt6.2□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 STF1YDL130W-A 261 nt6.19□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.19□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 CDD1YLR245C 429 nt6.19□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 YBR056WYBR056W 1506 nt6.19□□□□□ -1.42
YPL162CQ12042 MAL31YBR298C 1845 nt6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97.5 ms