Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppp4r2Q0VGB7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppp4r2Q0VGB7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp4r2Q0VGB7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppp4r2Q0VGB7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms