Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39dQ0VF76 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc39dQ0VF76 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc39dQ0VF76 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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Ttc39dQ0VF76 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc39dQ0VF76 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc39dQ0VF76 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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