Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisal1Q0VBP7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisal1Q0VBP7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal1Q0VBP7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms