Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif3aQ0VBL6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif3aQ0VBL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hif3aQ0VBL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif3aQ0VBL6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif3aQ0VBL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms