Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah2Q06986 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah2Q06986 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Siah2Q06986 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms