Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrx2Q06348 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrx2Q06348 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prrx2Q06348 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms