Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SryQ05738 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SryQ05738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SryQ05738 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SryQ05738 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SryQ05738 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SryQ05738 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SryQ05738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SryQ05738 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SryQ05738 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SryQ05738 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SryQ05738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SryQ05738 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SryQ05738 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SryQ05738 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SryQ05738 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SryQ05738 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SryQ05738 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SryQ05738 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SryQ05738 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SryQ05738 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SryQ05738 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SryQ05738 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SryQ05738 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SryQ05738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SryQ05738 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SryQ05738 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SryQ05738 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SryQ05738 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SryQ05738 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SryQ05738 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SryQ05738 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SryQ05738 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SryQ05738 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SryQ05738 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SryQ05738 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SryQ05738 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SryQ05738 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SryQ05738 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SryQ05738 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SryQ05738 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SryQ05738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SryQ05738 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SryQ05738 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SryQ05738 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SryQ05738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SryQ05738 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SryQ05738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SryQ05738 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SryQ05738 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SryQ05738 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SryQ05738 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SryQ05738 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SryQ05738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SryQ05738 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SryQ05738 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SryQ05738 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SryQ05738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SryQ05738 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SryQ05738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SryQ05738 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SryQ05738 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SryQ05738 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SryQ05738 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SryQ05738 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SryQ05738 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SryQ05738 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SryQ05738 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SryQ05738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SryQ05738 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SryQ05738 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SryQ05738 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SryQ05738 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SryQ05738 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SryQ05738 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SryQ05738 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SryQ05738 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SryQ05738 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SryQ05738 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SryQ05738 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SryQ05738 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SryQ05738 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SryQ05738 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SryQ05738 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SryQ05738 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SryQ05738 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SryQ05738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SryQ05738 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SryQ05738 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SryQ05738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SryQ05738 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SryQ05738 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SryQ05738 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SryQ05738 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms