Protein–RNA interactions for Protein: Q04758

Pkib, cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkibQ04758 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PkibQ04758 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkibQ04758 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkibQ04758 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkibQ04758 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkibQ04758 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PkibQ04758 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PkibQ04758 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PkibQ04758 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PkibQ04758 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkibQ04758 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkibQ04758 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PkibQ04758 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PkibQ04758 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PkibQ04758 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkibQ04758 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkibQ04758 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkibQ04758 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PkibQ04758 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PkibQ04758 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PkibQ04758 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PkibQ04758 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PkibQ04758 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PkibQ04758 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PkibQ04758 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PkibQ04758 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PkibQ04758 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PkibQ04758 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PkibQ04758 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PkibQ04758 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PkibQ04758 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PkibQ04758 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PkibQ04758 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PkibQ04758 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PkibQ04758 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms