Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emx2Q04744 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emx2Q04744 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emx2Q04744 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Emx2Q04744 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Emx2Q04744 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Emx2Q04744 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx2Q04744 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Emx2Q04744 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Emx2Q04744 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Emx2Q04744 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms