Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Aplp1Q03157 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Aplp1Q03157 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aplp1Q03157 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aplp1Q03157 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Aplp1Q03157 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aplp1Q03157 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Aplp1Q03157 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Aplp1Q03157 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Aplp1Q03157 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Aplp1Q03157 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Aplp1Q03157 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Aplp1Q03157 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Aplp1Q03157 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Aplp1Q03157 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Aplp1Q03157 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Aplp1Q03157 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Aplp1Q03157 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Aplp1Q03157 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms