Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms