Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcqQ02111 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcqQ02111 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcqQ02111 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcqQ02111 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms