Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snai1Q02085 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snai1Q02085 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snai1Q02085 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Snai1Q02085 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Snai1Q02085 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms