Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsu1Q01730 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsu1Q01730 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsu1Q01730 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms