Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HmgcrQ01237 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HmgcrQ01237 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HmgcrQ01237 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HmgcrQ01237 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HmgcrQ01237 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HmgcrQ01237 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms