Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa1Q00623 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa1Q00623 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa1Q00623 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa1Q00623 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa1Q00623 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms