Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bop1P97452 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bop1P97452 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bop1P97452 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bop1P97452 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bop1P97452 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bop1P97452 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bop1P97452 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bop1P97452 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bop1P97452 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bop1P97452 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bop1P97452 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bop1P97452 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bop1P97452 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms