Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lig3P97386 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig3P97386 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig3P97386 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lig3P97386 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lig3P97386 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig3P97386 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lig3P97386 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lig3P97386 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lig3P97386 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig3P97386 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig3P97386 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lig3P97386 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms