Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frat1P70339 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frat1P70339 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frat1P70339 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frat1P70339 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frat1P70339 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frat1P70339 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frat1P70339 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frat1P70339 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frat1P70339 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frat1P70339 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frat1P70339 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frat1P70339 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frat1P70339 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frat1P70339 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frat1P70339 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms