Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif1P70284 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif1P70284 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif1P70284 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgif1P70284 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgif1P70284 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms