Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DccP70211 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DccP70211 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DccP70211 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DccP70211 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DccP70211 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DccP70211 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DccP70211 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DccP70211 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DccP70211 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DccP70211 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DccP70211 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DccP70211 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DccP70211 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DccP70211 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
DccP70211 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DccP70211 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DccP70211 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DccP70211 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DccP70211 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DccP70211 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DccP70211 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DccP70211 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DccP70211 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DccP70211 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DccP70211 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DccP70211 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DccP70211 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DccP70211 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DccP70211 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DccP70211 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DccP70211 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DccP70211 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
DccP70211 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
DccP70211 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DccP70211 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DccP70211 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DccP70211 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
DccP70211 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DccP70211 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DccP70211 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
DccP70211 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DccP70211 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DccP70211 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DccP70211 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DccP70211 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
DccP70211 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DccP70211 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DccP70211 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DccP70211 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DccP70211 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DccP70211 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DccP70211 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DccP70211 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DccP70211 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DccP70211 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
DccP70211 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DccP70211 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DccP70211 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DccP70211 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
DccP70211 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
DccP70211 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DccP70211 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DccP70211 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DccP70211 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DccP70211 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DccP70211 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DccP70211 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DccP70211 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DccP70211 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
DccP70211 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DccP70211 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DccP70211 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DccP70211 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DccP70211 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DccP70211 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DccP70211 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DccP70211 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DccP70211 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DccP70211 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DccP70211 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DccP70211 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DccP70211 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DccP70211 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DccP70211 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DccP70211 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DccP70211 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DccP70211 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DccP70211 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DccP70211 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DccP70211 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DccP70211 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DccP70211 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DccP70211 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DccP70211 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DccP70211 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DccP70211 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DccP70211 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DccP70211 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DccP70211 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms