Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ThraP63058 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ThraP63058 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ThraP63058 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ThraP63058 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ThraP63058 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ThraP63058 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ThraP63058 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ThraP63058 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ThraP63058 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ThraP63058 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ThraP63058 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ThraP63058 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ThraP63058 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ThraP63058 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ThraP63058 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ThraP63058 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ThraP63058 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ThraP63058 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ThraP63058 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ThraP63058 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ThraP63058 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ThraP63058 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ThraP63058 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ThraP63058 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ThraP63058 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ThraP63058 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ThraP63058 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ThraP63058 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ThraP63058 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ThraP63058 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ThraP63058 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ThraP63058 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThraP63058 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThraP63058 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThraP63058 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThraP63058 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThraP63058 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThraP63058 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ThraP63058 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ThraP63058 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ThraP63058 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ThraP63058 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ThraP63058 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ThraP63058 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ThraP63058 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ThraP63058 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ThraP63058 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ThraP63058 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ThraP63058 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThraP63058 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThraP63058 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThraP63058 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThraP63058 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ThraP63058 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ThraP63058 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThraP63058 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThraP63058 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ThraP63058 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ThraP63058 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThraP63058 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThraP63058 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThraP63058 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThraP63058 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThraP63058 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThraP63058 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThraP63058 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThraP63058 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThraP63058 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThraP63058 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThraP63058 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThraP63058 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ThraP63058 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ThraP63058 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ThraP63058 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThraP63058 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ThraP63058 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ThraP63058 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ThraP63058 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThraP63058 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThraP63058 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThraP63058 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThraP63058 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThraP63058 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ThraP63058 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ThraP63058 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ThraP63058 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ThraP63058 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ThraP63058 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ThraP63058 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ThraP63058 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ThraP63058 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ThraP63058 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ThraP63058 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms